الدكتور جورج حبيب بباوي يخرج ما في قلبه بعد قرار المجمع المقدس للأقباط الأرثوذكس برئاسة البابا شنودة وبإجماع أعضائه بفصل الدكتور جورج حبيب بباوي عميد معهد الدراسات اللاهوتية بولاية أنديانا الأمريكية وأستاذ اللاهوت السابق بالكلية الاكليركية الارثوذكية من الكنيسة بسبب أفكاره التي اعتبرتها خارجه على الكنيسة يفجر فضيحة من الأسرار الخطيرة فيقول
1- أن البابا شنودة خرب عقول أقباط مصر على مدى ثلاثين عاما بعقيدة فاسدة
2- وأنهم طلبوا منه سب والكتابة عن الأب متى المسكين فرفض
3- وان الأب متى المسكين عرض عليهم الصلح وان تعاد كتابه الكتب بتعليق عليها من البابا ولكن البابا رفض مع أن الأب متى المسكين أب اعتراف لشنودة
4- ويعترف لا توجد مراجع تاريخية للكنيسة
5- واعتبر البابا زواج الاثوذكسي من الكاثوليكية أو البروتستانتية زنا
6- إن الأنبا بيشوي أصدر فتوى قبطية بتحريم التبرع بدم الأقباط للمسلمين بدعوى أن دم المسيح موجود في الدورة الدموية للمسيحيين مما يؤهل المسلمين للدخول إلى السماء
7- أن البابا شنودة حاكمه لأنه قال أن المرآة ليست نجسه أثناء الطمث
8- أن البابا شنودة اكبر محرض على الفتنه وانه يثير الحقد على المسلمين وهو سبب جميع الفتن
9- أن البابا شنودة والأنبا بشوي أضافوا تعاليم لم تكن موجودة في المسيحية
10- أن البابا وبشوي يفسرون الإنجيل على هواهم ومن يخالفهم له العقاب والويل له
11- الأنبا بشوي لم يدرس في اى معهد لاهوتي ولا حتى في الكلية الاكليركية